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中新网北京10月10日电(记者 夏宾)中新网记者10日领会到,国际顶级学术期刊《Cell》在北京时候9日11时颁发了中山年夜学与阿里云合作的科研功效,研究团队操纵云计较与AI手艺发现了180个超群、16万余种全新RNA病毒,是已知病毒种类的近30倍,年夜幅晋升了业界对RNA病毒多样性和病毒演变汗青的认知。
《Cell》是国际公认的享有最高学术名誉的期刊之一,国内每一年入选《Cell》的论文数目唯一数十篇。此次入选的论文提出了一种基在深度进修的RNA病毒发现方式,是深度进修算法在病毒发现范畴的里程碑式进展,为病毒学研究首创了全新范式。
病毒与人类的健康紧密亲密相干,但人类已知已确认的病毒种类唯一5000余种,这只是病毒世界的冰山一角。传统RNA病毒判定方式高度依靠在序列同源性比对,即经由过程比力未知病毒与已知病毒的序列类似性来进行辨认。但是,RNA病毒种类繁多且高度分化,传统方式难以捕获缺少同源性或同源性极低的“暗物资病毒”,新病毒发现的效力较低。
AI与病毒学研究的连系正在冲破这一困难。本篇论文提出了全新的深度进修模子"LucaProt",它基在Transformer框架与年夜模子表征手艺,连系卵白质序列和内涵布局性特点,在自力的测试数据集上表示优良,具有极高的正确性(假阳性率仅为0.014%)和特异性(假阴性率为1.72%)。
据介绍,研究团队对来自全球生物情况样本的10487份数据进行病毒发掘,发现了513134条病毒基因组,代表161979个潜伏病毒种和180个RNA病毒超群。使RNA病毒超群数目扩容约9倍,病毒种类增添约30倍,此中23个超群没法经由过程序列同源方式辨认,被称为病毒圈的“暗物资”。
该论文还揭露了多个病毒学范畴新发现,例如发现迄今为止最长的RNA病毒基因组,长度到达47250个核苷酸;辨认出超越以往认知的基因组布局,展现了RNA病毒基因组进化的矫捷性。另外,在高温的深海热泉等极端情况中,RNA病毒照旧存在多样性。
中山年夜学医学院传授施莽暗示,在科研范畴,AI的利用已势不成挡,经由过程AI方式摸索科学问题已获得了主要冲破。“这类研究范式将成为将来科学界的常态,也可能成为我们认知世界的主要手段。”
该论文配合第一作者、阿里云飞天尝试室算法专家贺勇暗示,基在“AI+病毒学”的新研究框架刷新了人类对病毒圈的熟悉,跟着这类熟悉的不竭完美,有助在人类对将来可能产生的年夜风行进行预警,和进一步鞭策RNA病毒疫苗的研发。(完)
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